15 октября 1941г. в составе команды призывников был направлен Бирским райвоенкоматом в Курганскую военную школу авиамехаников (ВШАМ). 

На фронте с июля 1942г.

К ноябрю 1942г. пулеметчик 1 батальона 1 гвардейской танковой бригады.

В ночь на 27 ноября 1942г. участвовал в разведке линии обороны противника. Днем 27 ноября разминировал проход в противотанковом минном поле. В бою за деревню Малое Соино (Калининская обл.) огнем пулемета уничтожил 11 гитлеровцев.

Гвардии младший сержант Пугачев был представлен к ордену Красной Звезды, приказом от 13 декабря 1942г. награжден медалью «За отвагу».

К июлю 1943г. командир башни 1 танкового батальона.

Участник Курской битвы.

С 05 по 07 июля в боях за д.Яковлево (Курская обл.) экипаж танка уничтожил средний танк, автомашину, орудие и до 30 гитлеровцев. В бою был ранен командир танка. Николай Михайлович заменил его и лично уничтожил танк противника.

Приказом от 23 июля 1944г. гвардии старший сержант Пугачев был награжден орденом Отечественной войны I степени.

Был контужен. В июле 1944г. находился в составе приемо-распределительного батальона 239 армейского запасного стрелкового полка.

К декабрю 1944г. командир башни танка Т-34 3 танкового батальона. Командир батальона гвардии старший лейтенант Бутов Георгий Александрович.

26 декабря в бою за станцию Попельня (Житомирская обл.) экипаж танка уничтожил батарею полковых орудий, противотанковое орудие, автомашину с боеприпасами и 17 солдат и офицеров противника.

09 января в бою у с.Боровицы (Винницкая обл.)- 3 пушки калибра 75мм,  2 противотанковый орудия, автомашину и 8 повозок с боеприпасами, бронемашину, 6 пулеметов и 32 солдата и офицеров противника. 

Приказом от 22 января 1944г. гвардии старшина Пугачев был награжден орденом Красной Звезды.

К январю 1945г. командир танка 3 танкового батальона. Командир батальона капитан Малегов Петр Тимофеевич.

С 15 января бригада вела наступление на западном берегу р.Висла. 17 января захватила железнодорожный узел Згеж.

В составе группы из 3 танков вел бой за переправу в районе Кшевенице. Переправу оборонял батальон немецкой пехоты, два самоходных орудия и две артиллерийские батареи. Выйдя противнику в тыл, танкисту открыли огонь. Николай Михайлович уничтожил самоходное орудие, 2 полевые пушки и до 18 гитлеровцев. Его танк гусеницами раздавил две пушки. Переправа была захвачена.

20 января 1945г. гвардии старшина Пугачев был тяжело ранен.

Приказом от 19 июня 1945г. был награжден вторым орденом Отечественной войны I степени.

Награжден медалями «Зв освобождение Варшавы», «За победу над Германией в Великой Отечественной войне 1941–1945 гг.».

Участник Парада Победы в составе 4 батальона сводного полка 1 Белорусского фронта (командир сводного полка генерал-лейтенант Рослый Иван Павлович).

Гвардии старшина Пугаче демобилизован 14 ноября 1945г.